WC marin ne fonctionnent pas comme des toilettes sur terre. Ils ne peuvent pas, comme le voyage est parfois rude et toute eau stagnante serait barboter et de la toilette. L'eau de l'océan est pompé avec une pipe d'admission avant l'utilisation et un tuyau séparé décharge les déchets dans un réservoir de retenue ou directement dans l'océan. Hivernage, cependant, exige plus que juste pompage du réservoir de retenue car l'eau pourrait rester dans le système et causer des problèmes.